2011年，嘉兴港年集装箱吞吐量完成514981标箱，首次突破50万标箱，年货物吞吐量也首次突破5000万吨。

在嘉兴港集装箱和货物吞吐量实现连年快速增长的背后也包含了嘉兴检验检疫局对港口发展的努力。

一是加快软硬件设施建设，满足口岸集装箱量快速增长需求。该局自主研发进口集装箱检验检疫电子监管系统软件，与港口、货主或代理以及检疫处理单位之间实现电子化信息互通，有效提高工作效率。嘉兴港的进口集装箱货物以废物原料为主，放射线监测压力较大，该局增设通道式放射线监测仪，有效加快放射线检测速度并加大监测面。2011年10月，成功监测到一批进口钴精矿放射线严重超标，实施退运处理。

二是检疫处理前置，提高港区作业效率。针对港区须经检疫处理的集装箱量大的特点，该局将检疫处理工作位置前移，做到集装箱随到随处理。改变了原来集装箱先进堆场，再从堆场吊出来处理的传统模式，减少集装箱移箱次数，缩短集装箱在港时间至少1天，有效降低企业运作成本。

三是加强口岸查验合作，提高查验效率。嘉兴检验检疫局与嘉兴海关建立关检合作机制，把口岸合作查验作为合作机制的一项重要内容，能共同开箱查验的实现一次开箱查验，仅此一项，每年港区减少重复开箱7000多标箱，有效提高查验效率。

四是加快出口货物直通放行。嘉兴口岸切实落实“浙江省域出口商品直通放行”制度，对符合条件的出口商品实行直通放行，有效提高口岸通检效率，降低企业物流成本，进一步提升口岸竞争力。

嘉兴港在浙江省港口中的地位有了进一步提升，集装箱吞吐量和货物吞吐量均列浙江省港口第二。