合肥港综合码头位于合肥市包河区大圩镇迎河村，南淝河右岸。合肥港综合码头分三期建设，其中一期工程于2010年12月30日建成运营并开通内贸集装箱班轮，于2011年12月21日开通外贸集装箱班轮，使合肥实现了真正意义上的通江达海、江海直达。

合肥港通航一年来，运量已接近设计7万标箱的年集装箱吞吐量，集装箱通过水路运输至南京、上海，比陆路运输成本节约50%以上，且水路运输碳排放低。

为提高合肥港集装箱吞吐能力，作为一期工程补充的合肥港二期工程昨天正式开建，计划建设4个2000吨级多用途泊位，设计年吞吐量为集装箱43万标箱、件杂货59万吨。概算投资7.9亿元。建成后，将基本满足合肥及周边地区集装箱水路运输需要。目前，三期工程正在筹备当中。