泛亚铁路在中国国境内段，资金大部分来源政府财政。负责泛亚铁路东线建设的滇南铁路有限责任公司综合部告诉记者，玉蒙铁路资金来源是国家的铁路建设基金，由云南铁路局代表铁道部，滇南铁路有限责任公司代表当地政府组建投资公司，分别出资60%和40%来进行建设。但这对于周边财力薄弱的东南亚国家来说，缺乏可复制性。而日前，云南潇湘泛亚投资有限公司以民营企业的身份获得了泛亚铁路中线老挝段的投资经营权，或为泛亚铁路建设打开了吸引民资参与的先河。
            
该公司董事长李占群在介绍自己的经验时给出了如下说法：“国内的国有企业当然也可以参与，但会比较麻烦，需要在发改委和铁道部立项审批，耗时较长，相对而言，民企来做就轻松很多。铁道部对潇湘公司修建老挝铁路十分支持，在技术方面会给予全力支持。”在谈到资金来源时，李占群介绍道，项目资金一部分来自联合国开发计划署提供给老挝的300万美元援建资金，老挝将其中一部分转给潇湘公司建设铁路；另一部分来自中国政府对老挝的援助款项，剩余部分则由李占群在海外跟朋友募集。而他对中老泰铁路的预算是300亿元人民币，对整个泛亚铁路的投资预想是300亿美元。除了铁路，这300亿美元还将用于铁路沿线的一些投资项目，例如老挝铁路沿线的农林开发、工业开发及矿产开发项目，特别是老挝丰富的有色金属矿藏，潇湘公司将获得优先开采权。“铁路的回报当然不会很快，但我相信沿线的这些开发项目对于投资者来说是很有吸引力的。”李占群同时表示，“目前工程资金已到位，前期工作已准备就绪。”而潇湘公司的目标不仅仅是泛亚中线铁路，如果老挝段建设顺利，他还将参与其他路段的竞标。但云南省政府参事、中国东南亚研究会副会长贺圣达认为，此举风险仍很高，其成果仍然值得关注。“国家没有钱，国际组织又看不上这样的地方。私人投资看重的是利润，这些地区铁路投资周期长、难度大、风险高，很难估算收益。”
            
而泛亚铁路的建设与中国-东盟自由贸易区(缩写为“CAFTA”，以下简称为“自贸区”)的发展密切相关，CAFTA2010年刚刚度过自己1岁的生日，这个涵盖11个国家、19亿人口、GDP达6万亿美元的巨大经济体在过去一年体现出了巨大的经济活力。根据目前公布的消息显示，如果建设顺利的话，前文所提到的中缅段以及中老泰段将在2015年建设完成，献礼自贸区5周年，更为重要的是路网的升级所带来的拉动作用将难以想像。“按照以前的模式，中南半岛国家往中国运送我们所需要的大宗农产品和资源产品多采取公路及水运，运力低，时间长，成本高。”从事中国-东盟区域经济研究的中国社科院研究员柴瑜说，“缅甸、柬埔寨等国家铁路运输能力显然与逐渐趋于一体化发展的自贸区不相符。”泛亚铁路的建设将为自贸区内的物流运转大大加速，无论从速度还是量级上都不可同日而语。不仅如此，泛亚铁路还将为中国战略物资的运输、尤其是石油运输提供新的选择。泛亚铁路一旦建成后，可以分担海运和管道运输的风险。“中南半岛、印度半岛铁路网连通后，中国进口资源，特别是石油就可不再绕道马六甲海峡，而直接通过西部陆路入境，节省了成本，也保障了资源安全。”中国工程院院士王梦恕介绍道。昆明理工大学物流工程系杨扬博士也表示，网络化的交通基础设施建设将极大推动云南省与东盟各国之间的国际物流和区域物流的发展，将使昆明真正成为带动云南省，辐射大西南，连接东、中、西部，面向东南亚、南亚、西亚、南欧、非洲的国际物流枢纽城市。