开行铁路集装箱直达列车是集装箱运输先进的组织方式。目前，世界各国的铁路集装箱运输均采用了直达列车的运输组织形式，特别是定期直达列车的开行，为集装箱运输的发展注入了新的活力。
 
集装箱直达列车的种类：
 
集装箱直达列车开行对集装箱运输的发展起了很大的推动作用。但各个国家，各个不同发展时期组织直达列车的形式也不尽一致。集装箱直达列车应如何组织要根据国家陆域的大小、主要货源的分布、铁路运输设备等情况加以确定，并贯彻运送速度快、服务质量优、运营成本低的原则。根据不同情况，集装箱直达列车主要有以下几种组织形式：
 
从列车组织上，有定期直达列车和不定期直达列车两种组织形式。定期直达列车即定点定线定期运行，采取预约列车箱位，按期进货，准点发到的组织措施，发送到达有确定的时间，运行速度快，为货主提供了可靠的货运手段。不定期直达列车是根据运输需要临时编开集装箱直达列车，所以也叫做专用直达列车。它主要用于港口至内陆的集装箱疏运。集装箱船集中到达时，需要几列或几十列直达列车疏运，所以不可能铺划专用的运行线。由于不是定点定线开行，列车速度受到一定影响。
 
从列车编组上，有短列直达列车、普通直达列车和组合直达列车三种。在运营不是很集中，运送距离又不长的情况下，为了减少货物集结时间，可开行短列直达列车；在运量大、运距较长的情况下，可开行普通长度的直达列车；在运营集中、运距较长的情况下，可开行组合直达列车或重载列车。一般的小陆域国家的内陆运输以开行短列直达列车为主，列车运行速度快、周期短、间隔小，适合内陆地区货物运输要求速度快、时间比较灵活的特点。对一般的大陆域国家，在货源比较集中的地区之间以开行普通直达列车为宜。在港口至内陆或港口至港口之间，为了及时疏港，又有运量高度集中的特点，可开行组合直达列车或重载列车。特别是双层集装箱列车的出现，使得集装箱列车的装箱量得到了很大的提高。如美国的双层集装箱直达列车，每列编组140 辆，能装载集装箱560TEu 。
 
从车底组成上，集装箱直达列车有固定车底循环和不固定车底两种。在运量较大、货源稳定的车站（港口）之间，可开行集装箱专用车组成的固定车底循环直达列车，这种列车可以通过所有的编组站而不进行改编，一方面加快了列车运行速度，另一方面减轻了编组站的负担。在集装箱直达列车的一端或两端货物到站比较分散的情况下，列车只好解体，重新编组后继续运行，这样就只能开行不固定车底的直达列车。
 
从作业方式上，集装箱直达列车有一站直达和有途中作业的两种。一站直达是指直达列车从装车站（编组站）至到达站途中没有货运作业；途中作业是指在直达列车的组织站到终到站之间有货运作业，即列车在途中不解体，经过货运站时，可进行集装箱的装卸作业，这为运量较小的车站组织集装箱直达列车提供了条件，日本大量采用了途中作业直达列车的组织形式。